一、高精準度(定性、定量) – 高效液相層析儀(HPLC)或液相層析串聯質譜儀(LC MS/MS)及氣相層析質譜儀（GC/MS）
這三種檢驗方法為國際間公認的標準方法，在操作這些設備時需要有非常專業的作業人員來進行樣品的前置處理與後續的操作，而這類的檢驗方法結果精準，且可以精確的判讀”質”與”量”，例如我們要檢驗食品中是否有磺胺類藥物的殘留，使用液相層析串聯質譜儀，我們就可以知道食品中有哪些磺胺類藥物的殘留以及各個藥物殘留的量有多少。這些儀器非常靈敏(精準)，如果樣品的前置處理不確實，檢驗出來的結果就不準確，因此通常需要有經驗的專業人員來進行。而這些檢驗儀器設備價格昂貴，在加上每年的維護費用，使得許多食品業者卻步。所以許多食品業者將樣品送至第三方檢驗單位如:SGS、全國公證….等進行檢驗。
二、高效率(定性、定量) – ELISA 酵素連結免疫吸附分析法
ELISA 酵素連結免疫吸附法之原理是利用抗原-抗體免疫鍵結反應，將酵素連接到抗原或抗體分子上來偵測想檢測的抗原或抗體分子，最後加上酵素的受質，依其呈色強弱以評估檢體中待測物存在的濃度。ELISA檢驗也需要儀器設備與專業的作業人員進行操作，但人員的訓練相對層析儀就簡單許多，ELISA檢驗可對大量檢體進行篩選，搭配簡易的儀器設備即可進行定量檢測，整個檢驗作業可於1小時內判讀檢驗結果。ELISA檢驗儀器相對於使用高效液相層析儀價格便宜許多，檢驗速度也更快，同時也可”定性”與”定量”，因此受到許多設有專業QC單位的食品廠信賴。
三、最快速、最實惠(定性、半定量) – 快篩檢驗試劑(Rapid Test)
快篩檢驗試劑其原理是藉由抗原抗體間的專一性與免疫親和力做檢測依據，並以奈米等級膠體金顆粒(Colloidal gold)作為顯色劑來進行結果判讀。快篩檢驗試劑不需要昂貴的儀器設備，操作人員只需要有基本概念，即可快速上手。快篩檢驗試劑進行樣品的前置處理後，只需5-10分鐘即可立即判讀檢驗結果。其檢驗成本低(100/次)，檢驗速度快，通常做為食品原料的初篩工具。